最早的“中华民国在中国”，早在一九四九年十月一日已被共产党推翻，中华人民共和国成立，中国的中华民国寿终正寝。一九五〇年，蒋介石在台湾草山复行视事，也承认几乎亡国；蒋介石心态是寄居台湾，口口声声维持法统、反攻大陆，那阶段是“中华民国到台湾”。

直到前总统李登辉宣布解严，中华民国有效领域是台澎金马，当时“中华民国在台湾”，过去长达四十年，中华民国寄生台湾，相当虚无缥缈。

吕秀莲坚持认为：一九九六年三月廿三日李登辉参加总统直选后，台湾是主权独立国家，选出来的是中华民国总统，那一天“中华民国是台湾”，名字叫“台湾中华民国”。

“中华民国有两个”，就是中国的中华民国和台湾的中华民国；如果想倒回中国的中华民国，面对中华人民共和国，中华民国一定被消灭。马总统一年来的执政虚无缥缈，因为他全心全意想的是过去中国的中华民国，马英九是“失根的兰花”，因为不认同台湾。

吕秀莲还向马英九献计献策说：对于国、共两党打算共同庆祝“辛亥一百年”，很多人断言，那是正式宣布结束中华民国，因为中华民国一九四九年在中华人民共和国面前早就投降了，如果马英九聪明就该拒绝，依附台湾才存在第二个中华民国，如果想开历史倒车，两个中华民国都会被消灭掉。

我呼吁，马总统应召开国是会议，朝野谈清楚，最大公约数就是“台湾中华民国”，捍卫中华民国的人搞清楚，愈拥抱台湾愈能存活；至于独派不喜欢中华民国，那就关起门来吵。我考虑以玉山周报创办人身份，专访马总统；我希望向马请益国家定位问题，这也是大家对马的疑怚所在。

对于上述“吕氏高谈阔论”，国民党执掌行政院的吴敦义院长嗤之以鼻，并把吕秀莲的奇谈怪论概括成为“一派胡言”。

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